El programa se lleva a cabo con el apoyo de los donantes del Fondo del CGIAR y por medio de acuerdos bilaterales de financiación:
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| Australia (ACIAR) |  |
| Estados Unidos (USAID) |  |
| Irlanda (Irish Aid) |  |
| Nueva Zelanda (Ministerio de Relaciones Exteriores y Comercio) |  |
| Países Bajos (Ministerio de Relaciones Exteriores) |  |
| Gobierno de Reino Unido (UK Aid) |  |
| Suiza (SDC) |  |
| Tailandia |  |
| Unión Europea (EU) |  |
| El programa es llevado a cabo con soporte técnico del Fondo Internacional para el Desarrollo Agrícola (IFAD) |  |
Donantes de la fase I de CCAFS (2011-2014)
- Donantes del Fondo CGIAR
- Australia (ACIAR)
- Gobierno de Canadá a través del Departamento Federal de Ambiente
- Dinamarca (DANIDA)
- Irlanda (Irish Aid)
- Países Bajos (Ministerio de Relaciones Exteriores)
- Nueva Zelanda
- Portugal (IICT)
- Gobierno de Reino Unido (UK Aid)
- Rusia (Ministerio de Hacienda)
- Suiza (SDC)
- Unión Europea (EU)
- Con soporte técnico del Fondo Internacional para el Desarrollo Agrícola (FIDA)